-
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Deniz Bilimleri Enstitisü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Laboratuvarı (ODTU-DBE-MBG) Kalkınma Bakanlığı'nın (Devlet Planlama Teşkilatı: DPT) katkısı ile kurulmuştur.
Laboratuvar;
Bu çalışmalardan bazılarının içeri şöyle özetlenebilir.
Mavi Biyoteknoloji (Deniz Biyoteknolojisi);
Genotoksikoloji:
Birçok kaynaktan atmosfere verilen kirleticilerin (Poli-halojenlenmiş Aromatik Hidrokarbonlar) veya fabrikalardan denizlere boşaltılan atık suların; başta kanser, hormonal bozukluklar, şeker hastalığı, gelişme bozuklukları, cinsiyetin dişi yönüne kayması olmak üzere birçok hastalığa neden olduğu bilinmektedir.
Genotoksikoloji çalışmaları bu hastalıklara neden olan kirleticilerin mekanizmalarını ortaya çıkararak bunlardan korunma ve tedavi yöntemlerini geliştirmekte aynı zamanda toplumun bu kaynaklara karşı bilinçlendirilmesini sağlamaktadır.
Populasyon genetiği çalışmaları;? Hem farklı denizlerimizde bulunan türlerin popilasyonlarının birbirleri ile olan hem de diğer denizlerde ve okyanuslarda bulunan akrabaları ile olan ilişkilerini ortaya çıkarmaktadır. Bu alanda elde edilen çıktılar türlerin geçmişleri hakkında bilgi verirken aynı zamanda gelecek potansiyellerini de ortaya koymaktadır böylece yetiştiricilik çalışmaları işin en uygun ırkların/türlerin seçilmesini sağlamaktadır.
Yukarıda bildirilen çalışmaların çıktıları, karşılıklı olarak belirlenecek koşullar çerçevesinde aşağıda bildirilen Bakanlıklar tarafından kullanılabilecektir.
ODTU-DBE Moleküler Biyoloji ve Genetik Laboratuvarında yürütülen Projeler;
ROCHE 480 II Real Time PCR Cihazı
Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemi (PCR) ile nükleik asitlerin (DNA ve RNA) belirlenen hedef bölgesinin yükseltgenme işlemini gerçekleştirmesinin yanında tam zamanlı olarak ürünlerin miktarını bildirmekte ve yüksek çüzünürlükteki erime değeri grafikleri sayesinde hedef bölgeler arasındaki farklılıkları ortaya koymaktadır.
Klasik PCR cihazı (T100-BIORAD)
Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemi (PCR) ile nükleik asitlerin (DNA ve RNA) belirlenen hedef bölgesinin yükseltgenme işleminin otomatik olarak gerçekleştirilmesi için dizayn edilmiş bir cihazdır. Böylece istenilen DNA bölgesinin milyonlarca kopyası yapılmaktadır.
Çeker Ocak ve Hassas Terazi
Tehlikeli sıvılar ile çalışılırken veya kimyasallar tartılırken güvenli bir ortam sağlayan şeker ocak ve içinde bulunan yüksek hassasiyetteki terazi.
Jel Görüntüleme Sistemi (Quantum ST4 VILBER LOURMAT)
UV ışımalı elektroforez jelleri, protein jelleri, otoradyogramlar, blotlar, dot blotlar, ince tabaka kromatografi plakaları gibi örneklerden görüntü almaya ve bunları analiz etmeye sağlayan sistemdir. Sistem görüntüyü basmaya yarayan Sony marka özel bir yazıcı ve donanımlı bir bilgisayara sahiptir.
Elektroforez Sistemi (AI-BII) ve Güç Kaynağı
Sistem, yatay jeller kullanılarak, nükleik asit ve protein ayrıştırması için bir çok avantajlar sunan ve moleküler biyoloji araştırmaları için temel bir araç teşkil eden elektroforezi gerçekleştirmektedir.
Soğutucular ve Dondurucular
Buzdolabı ver %20 derin dondurucu numune ve sarf malzemelerin korunması için kullanılmaktadır.
Buz makinesi (SCOTSMAN)
Deney düzeneği içerisindeki enzimlerin zamanından önce aktifleşmesini engellemek ve bozulmalarını önlemek için deneyin kar içinde hazırlanması gerekmektedir. Cihaz bu amaçlar için gerekli olan kırık buzu üretmektedir.
Tek ve çok kanallı Mikropipet Setleri (Thermo)
Proje kapsamında alınan iki set; 0,2-2Il, 2-20 �l, 20-200ul ve 100-1000ül hacimli Mikropipetler sayesinde küçük hacimli sıvılar ölçülmektedir. Ayrıca değişik hacimlerdeki 8 kanallı pipetler sayesinde 96 kuyucuklu deney düzenekleri hızlı bir şekilde hazırlanabilmektedir
Otoklav (ALP-54 lt )
Basınçlı su buharı ile doymuş bir ortamda 121⁰ derece sıcaklıkta sterilizasyon yapan cihaz sayesinde laboratuvar sarf malzemesi ve sol,syonlarının sterilizasyonu sağlanmaktadır.
Steril Kabin
Deney düzenekleri hazırlanırken her türlü bulaşmayı önleyen, aynı zamanda izole edilen DNA/RNA'ların kurutulduğu steril kabin.
Microsantrifüj, Vortex, Microdalga Fırın
Karışımları, çökelme prensibine göre tabakalara ayıran santrifüj, Agaroz jellerin hazırlanmasında kullanılan mikrodalga fırın ve küçük hacimlerin karıştırılmasını sağlayan vorteks.
Tezgah ve Dolaplar
Yüksek sıcaklık ve aside dayanıklı olan tezgahlar deneylerin yapılması için ortam oluşturmaktadır.